高中生侦探工藤新一因为试图跟踪黑衣组织成员而被偷袭,并被灌下代号“APTX4869”的毒药,虽然幸免于死,但身体就此缩小成一年级小学生的模样,在阿笠博士的提议下,寄住于小兰的父亲毛利小五郎家中,不仅解决着各种案件,并且秘密调查黑衣组织。而他的真实身份一直隐藏在暗处,那么到目前为止都有什么人知晓他的真身呢?
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阿笠博士
在新一被变小后,他介绍新一寄宿在毛利小五郎家中,而且还发明了许多设备帮助新一破案,是柯南最信任的理解者、协助者。柯南所使用的道具都是由其发明。现与灰原哀住在一起。爱车是大众甲壳虫。是第一个知道江户川柯南真正身份的人。